Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shcbp1Q9Z179 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shcbp1Q9Z179 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shcbp1Q9Z179 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Shcbp1Q9Z179 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shcbp1Q9Z179 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shcbp1Q9Z179 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shcbp1Q9Z179 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shcbp1Q9Z179 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shcbp1Q9Z179 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shcbp1Q9Z179 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shcbp1Q9Z179 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shcbp1Q9Z179 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Shcbp1Q9Z179 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shcbp1Q9Z179 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shcbp1Q9Z179 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shcbp1Q9Z179 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shcbp1Q9Z179 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shcbp1Q9Z179 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shcbp1Q9Z179 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shcbp1Q9Z179 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shcbp1Q9Z179 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shcbp1Q9Z179 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shcbp1Q9Z179 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shcbp1Q9Z179 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shcbp1Q9Z179 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shcbp1Q9Z179 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shcbp1Q9Z179 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shcbp1Q9Z179 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shcbp1Q9Z179 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shcbp1Q9Z179 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shcbp1Q9Z179 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shcbp1Q9Z179 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shcbp1Q9Z179 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shcbp1Q9Z179 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shcbp1Q9Z179 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shcbp1Q9Z179 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms