Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne6Q9Z140 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne6Q9Z140 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne6Q9Z140 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne6Q9Z140 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpne6Q9Z140 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne6Q9Z140 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpne6Q9Z140 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne6Q9Z140 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne6Q9Z140 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne6Q9Z140 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne6Q9Z140 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpne6Q9Z140 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpne6Q9Z140 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpne6Q9Z140 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpne6Q9Z140 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpne6Q9Z140 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpne6Q9Z140 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpne6Q9Z140 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpne6Q9Z140 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpne6Q9Z140 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpne6Q9Z140 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpne6Q9Z140 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cpne6Q9Z140 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cpne6Q9Z140 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.4 ms