Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sh3bp5Q9Z131 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sh3bp5Q9Z131 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sh3bp5Q9Z131 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Sh3bp5Q9Z131 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sh3bp5Q9Z131 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sh3bp5Q9Z131 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sh3bp5Q9Z131 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sh3bp5Q9Z131 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sh3bp5Q9Z131 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sh3bp5Q9Z131 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sh3bp5Q9Z131 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sh3bp5Q9Z131 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sh3bp5Q9Z131 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sh3bp5Q9Z131 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sh3bp5Q9Z131 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sh3bp5Q9Z131 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sh3bp5Q9Z131 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sh3bp5Q9Z131 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sh3bp5Q9Z131 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Sh3bp5Q9Z131 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Sh3bp5Q9Z131 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Sh3bp5Q9Z131 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sh3bp5Q9Z131 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Sh3bp5Q9Z131 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Sh3bp5Q9Z131 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sh3bp5Q9Z131 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sh3bp5Q9Z131 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sh3bp5Q9Z131 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sh3bp5Q9Z131 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sh3bp5Q9Z131 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sh3bp5Q9Z131 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sh3bp5Q9Z131 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sh3bp5Q9Z131 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sh3bp5Q9Z131 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Sh3bp5Q9Z131 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sh3bp5Q9Z131 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sh3bp5Q9Z131 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sh3bp5Q9Z131 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sh3bp5Q9Z131 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sh3bp5Q9Z131 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sh3bp5Q9Z131 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sh3bp5Q9Z131 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sh3bp5Q9Z131 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sh3bp5Q9Z131 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sh3bp5Q9Z131 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Sh3bp5Q9Z131 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sh3bp5Q9Z131 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sh3bp5Q9Z131 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sh3bp5Q9Z131 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sh3bp5Q9Z131 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Sh3bp5Q9Z131 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sh3bp5Q9Z131 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sh3bp5Q9Z131 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sh3bp5Q9Z131 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sh3bp5Q9Z131 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sh3bp5Q9Z131 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sh3bp5Q9Z131 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sh3bp5Q9Z131 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Sh3bp5Q9Z131 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sh3bp5Q9Z131 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sh3bp5Q9Z131 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sh3bp5Q9Z131 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sh3bp5Q9Z131 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sh3bp5Q9Z131 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Sh3bp5Q9Z131 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sh3bp5Q9Z131 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sh3bp5Q9Z131 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sh3bp5Q9Z131 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sh3bp5Q9Z131 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms