Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb6Q9Z0T9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb6Q9Z0T9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb6Q9Z0T9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb6Q9Z0T9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb6Q9Z0T9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb6Q9Z0T9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb6Q9Z0T9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb6Q9Z0T9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb6Q9Z0T9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb6Q9Z0T9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb6Q9Z0T9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb6Q9Z0T9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Itgb6Q9Z0T9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb6Q9Z0T9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb6Q9Z0T9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb6Q9Z0T9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb6Q9Z0T9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb6Q9Z0T9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb6Q9Z0T9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb6Q9Z0T9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb6Q9Z0T9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb6Q9Z0T9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb6Q9Z0T9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb6Q9Z0T9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb6Q9Z0T9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb6Q9Z0T9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb6Q9Z0T9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms