Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trim10Q9WUH5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim10Q9WUH5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim10Q9WUH5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim10Q9WUH5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim10Q9WUH5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim10Q9WUH5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim10Q9WUH5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim10Q9WUH5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim10Q9WUH5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim10Q9WUH5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim10Q9WUH5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim10Q9WUH5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim10Q9WUH5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim10Q9WUH5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim10Q9WUH5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim10Q9WUH5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim10Q9WUH5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim10Q9WUH5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim10Q9WUH5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim10Q9WUH5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim10Q9WUH5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim10Q9WUH5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim10Q9WUH5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim10Q9WUH5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim10Q9WUH5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim10Q9WUH5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim10Q9WUH5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim10Q9WUH5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim10Q9WUH5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim10Q9WUH5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim10Q9WUH5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim10Q9WUH5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim10Q9WUH5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim10Q9WUH5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim10Q9WUH5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim10Q9WUH5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim10Q9WUH5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim10Q9WUH5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim10Q9WUH5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim10Q9WUH5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim10Q9WUH5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim10Q9WUH5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim10Q9WUH5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim10Q9WUH5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim10Q9WUH5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim10Q9WUH5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim10Q9WUH5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim10Q9WUH5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim10Q9WUH5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim10Q9WUH5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim10Q9WUH5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim10Q9WUH5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim10Q9WUH5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim10Q9WUH5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim10Q9WUH5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim10Q9WUH5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim10Q9WUH5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim10Q9WUH5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim10Q9WUH5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim10Q9WUH5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim10Q9WUH5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim10Q9WUH5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim10Q9WUH5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim10Q9WUH5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim10Q9WUH5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim10Q9WUH5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim10Q9WUH5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim10Q9WUH5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms