Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Scn8aQ9WTU3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Scn8aQ9WTU3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Scn8aQ9WTU3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Scn8aQ9WTU3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Scn8aQ9WTU3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Scn8aQ9WTU3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Scn8aQ9WTU3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Scn8aQ9WTU3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Scn8aQ9WTU3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Scn8aQ9WTU3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Scn8aQ9WTU3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Scn8aQ9WTU3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Scn8aQ9WTU3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Scn8aQ9WTU3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Scn8aQ9WTU3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Scn8aQ9WTU3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Scn8aQ9WTU3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Scn8aQ9WTU3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Scn8aQ9WTU3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Scn8aQ9WTU3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Scn8aQ9WTU3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Scn8aQ9WTU3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Scn8aQ9WTU3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Scn8aQ9WTU3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Scn8aQ9WTU3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Scn8aQ9WTU3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Scn8aQ9WTU3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Scn8aQ9WTU3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Scn8aQ9WTU3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Scn8aQ9WTU3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Scn8aQ9WTU3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Scn8aQ9WTU3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Scn8aQ9WTU3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Scn8aQ9WTU3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Scn8aQ9WTU3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Scn8aQ9WTU3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Scn8aQ9WTU3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Scn8aQ9WTU3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Scn8aQ9WTU3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Scn8aQ9WTU3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Scn8aQ9WTU3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Scn8aQ9WTU3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Scn8aQ9WTU3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Scn8aQ9WTU3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Scn8aQ9WTU3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Scn8aQ9WTU3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Scn8aQ9WTU3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Scn8aQ9WTU3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Scn8aQ9WTU3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Scn8aQ9WTU3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Scn8aQ9WTU3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Scn8aQ9WTU3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Scn8aQ9WTU3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Scn8aQ9WTU3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Scn8aQ9WTU3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Scn8aQ9WTU3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Scn8aQ9WTU3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Scn8aQ9WTU3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Scn8aQ9WTU3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Scn8aQ9WTU3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Scn8aQ9WTU3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Scn8aQ9WTU3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Scn8aQ9WTU3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Scn8aQ9WTU3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Scn8aQ9WTU3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Scn8aQ9WTU3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Scn8aQ9WTU3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Scn8aQ9WTU3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Scn8aQ9WTU3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Scn8aQ9WTU3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Scn8aQ9WTU3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Scn8aQ9WTU3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms