Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh13Q9WTR5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh13Q9WTR5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh13Q9WTR5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdh13Q9WTR5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh13Q9WTR5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh13Q9WTR5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh13Q9WTR5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh13Q9WTR5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh13Q9WTR5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh13Q9WTR5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh13Q9WTR5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh13Q9WTR5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh13Q9WTR5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh13Q9WTR5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdh13Q9WTR5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh13Q9WTR5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh13Q9WTR5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh13Q9WTR5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh13Q9WTR5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh13Q9WTR5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh13Q9WTR5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh13Q9WTR5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh13Q9WTR5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh13Q9WTR5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdh13Q9WTR5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdh13Q9WTR5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdh13Q9WTR5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh13Q9WTR5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh13Q9WTR5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh13Q9WTR5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh13Q9WTR5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh13Q9WTR5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh13Q9WTR5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh13Q9WTR5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh13Q9WTR5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh13Q9WTR5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh13Q9WTR5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh13Q9WTR5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh13Q9WTR5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh13Q9WTR5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh13Q9WTR5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms