Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim3Q9R1R2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim3Q9R1R2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim3Q9R1R2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim3Q9R1R2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim3Q9R1R2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim3Q9R1R2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim3Q9R1R2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim3Q9R1R2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim3Q9R1R2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim3Q9R1R2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim3Q9R1R2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim3Q9R1R2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms