Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntn3Q9R1A3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ntn3Q9R1A3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ntn3Q9R1A3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ntn3Q9R1A3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ntn3Q9R1A3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ntn3Q9R1A3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ntn3Q9R1A3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ntn3Q9R1A3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ntn3Q9R1A3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ntn3Q9R1A3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ntn3Q9R1A3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ntn3Q9R1A3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ntn3Q9R1A3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ntn3Q9R1A3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ntn3Q9R1A3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ntn3Q9R1A3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ntn3Q9R1A3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ntn3Q9R1A3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ntn3Q9R1A3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ntn3Q9R1A3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ntn3Q9R1A3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ntn3Q9R1A3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ntn3Q9R1A3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ntn3Q9R1A3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ntn3Q9R1A3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms