Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clec4eQ9R0Q8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec4eQ9R0Q8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec4eQ9R0Q8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec4eQ9R0Q8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec4eQ9R0Q8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec4eQ9R0Q8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec4eQ9R0Q8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec4eQ9R0Q8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec4eQ9R0Q8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec4eQ9R0Q8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec4eQ9R0Q8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec4eQ9R0Q8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec4eQ9R0Q8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec4eQ9R0Q8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clec4eQ9R0Q8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec4eQ9R0Q8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec4eQ9R0Q8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec4eQ9R0Q8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec4eQ9R0Q8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec4eQ9R0Q8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clec4eQ9R0Q8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4eQ9R0Q8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clec4eQ9R0Q8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4eQ9R0Q8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4eQ9R0Q8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec4eQ9R0Q8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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