Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrpxQ9R0M3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrpxQ9R0M3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrpxQ9R0M3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrpxQ9R0M3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrpxQ9R0M3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrpxQ9R0M3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrpxQ9R0M3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrpxQ9R0M3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpxQ9R0M3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpxQ9R0M3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpxQ9R0M3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrpxQ9R0M3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrpxQ9R0M3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrpxQ9R0M3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpxQ9R0M3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpxQ9R0M3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpxQ9R0M3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrpxQ9R0M3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpxQ9R0M3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrpxQ9R0M3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrpxQ9R0M3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrpxQ9R0M3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrpxQ9R0M3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrpxQ9R0M3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrpxQ9R0M3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrpxQ9R0M3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrpxQ9R0M3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrpxQ9R0M3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrpxQ9R0M3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrpxQ9R0M3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrpxQ9R0M3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrpxQ9R0M3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrpxQ9R0M3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpxQ9R0M3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpxQ9R0M3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrpxQ9R0M3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrpxQ9R0M3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrpxQ9R0M3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrpxQ9R0M3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrpxQ9R0M3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrpxQ9R0M3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrpxQ9R0M3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms