Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc6Q9R087 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc6Q9R087 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc6Q9R087 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpc6Q9R087 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc6Q9R087 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms