Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itgb1bp2Q9R000 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb1bp2Q9R000 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb1bp2Q9R000 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb1bp2Q9R000 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb1bp2Q9R000 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb1bp2Q9R000 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb1bp2Q9R000 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb1bp2Q9R000 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb1bp2Q9R000 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb1bp2Q9R000 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb1bp2Q9R000 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb1bp2Q9R000 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb1bp2Q9R000 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb1bp2Q9R000 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb1bp2Q9R000 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb1bp2Q9R000 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb1bp2Q9R000 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb1bp2Q9R000 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb1bp2Q9R000 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb1bp2Q9R000 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb1bp2Q9R000 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb1bp2Q9R000 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb1bp2Q9R000 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb1bp2Q9R000 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb1bp2Q9R000 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb1bp2Q9R000 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb1bp2Q9R000 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb1bp2Q9R000 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb1bp2Q9R000 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb1bp2Q9R000 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms