Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc4Q9QZD4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc4Q9QZD4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc4Q9QZD4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc4Q9QZD4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc4Q9QZD4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc4Q9QZD4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc4Q9QZD4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc4Q9QZD4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ercc4Q9QZD4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc4Q9QZD4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc4Q9QZD4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc4Q9QZD4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc4Q9QZD4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc4Q9QZD4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc4Q9QZD4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc4Q9QZD4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc4Q9QZD4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc4Q9QZD4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ercc4Q9QZD4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc4Q9QZD4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc4Q9QZD4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc4Q9QZD4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc4Q9QZD4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc4Q9QZD4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc4Q9QZD4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc4Q9QZD4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc4Q9QZD4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc4Q9QZD4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc4Q9QZD4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc4Q9QZD4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc4Q9QZD4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc4Q9QZD4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc4Q9QZD4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms