Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc39a1Q9QZ03 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc39a1Q9QZ03 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc39a1Q9QZ03 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc39a1Q9QZ03 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc39a1Q9QZ03 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc39a1Q9QZ03 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc39a1Q9QZ03 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc39a1Q9QZ03 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc39a1Q9QZ03 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc39a1Q9QZ03 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc39a1Q9QZ03 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc39a1Q9QZ03 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc39a1Q9QZ03 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc39a1Q9QZ03 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc39a1Q9QZ03 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc39a1Q9QZ03 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc39a1Q9QZ03 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc39a1Q9QZ03 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc39a1Q9QZ03 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc39a1Q9QZ03 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc39a1Q9QZ03 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc39a1Q9QZ03 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc39a1Q9QZ03 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc39a1Q9QZ03 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc39a1Q9QZ03 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc39a1Q9QZ03 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc39a1Q9QZ03 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc39a1Q9QZ03 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc39a1Q9QZ03 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc39a1Q9QZ03 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc39a1Q9QZ03 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc39a1Q9QZ03 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc39a1Q9QZ03 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc39a1Q9QZ03 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc39a1Q9QZ03 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc39a1Q9QZ03 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms