Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
ChmQ9QXG2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
ChmQ9QXG2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,52■■□□□ 1,84
ChmQ9QXG2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,52■■□□□ 1,84
ChmQ9QXG2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,52■■□□□ 1,84
ChmQ9QXG2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,84
ChmQ9QXG2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,48■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
ChmQ9QXG2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
ChmQ9QXG2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
ChmQ9QXG2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
ChmQ9QXG2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26,39■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26,36■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26,33■■□□□ 1,81
ChmQ9QXG2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26,33■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26,31■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,31■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26,3■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
ChmQ9QXG2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,24■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
ChmQ9QXG2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26,2■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,16■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,15■■□□□ 1,78
ChmQ9QXG2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
ChmQ9QXG2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
ChmQ9QXG2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
ChmQ9QXG2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
ChmQ9QXG2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
ChmQ9QXG2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
ChmQ9QXG2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
ChmQ9QXG2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26,1■■□□□ 1,77
ChmQ9QXG2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
ChmQ9QXG2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
ChmQ9QXG2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
ChmQ9QXG2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
ChmQ9QXG2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
ChmQ9QXG2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
ChmQ9QXG2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
ChmQ9QXG2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,8 ms