Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA2-202ENST00000502960 721 ntTSL 220.27■□□□□ 0.842e-8■■■■□ 24.9
APOBEC3CQ9NRW3 ATXN7L3B-201ENST00000519948 7604 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.433e-8■■■■□ 24.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 24.7
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA2-203ENST00000510680 576 ntTSL 214.45□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 24.7
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA2-204ENST00000512088 627 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.391e-6■■■■□ 24.7
APOBEC3CQ9NRW3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.236e-10■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 COX5B-202ENST00000464949 613 ntTSL 522.38■■□□□ 1.176e-10■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 COX5B-203ENST00000491989 611 ntTSL 310.44□□□□□ -0.746e-10■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.614e-9■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.44e-9■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.164e-9■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPD-211ENST00000514671 1089 ntTSL 58.7□□□□□ -1.024e-9■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPD-210ENST00000514325 4597 ntTSL 1 (best)4.6□□□□□ -1.674e-9■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-51■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.452e-51■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 212.01□□□□□ -0.492e-51■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.46e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.166e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 327.27■■□□□ 1.966e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 MACROD1-203ENST00000538595 868 ntTSL 326.91■■□□□ 1.96e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.26e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.116e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 PSMG1-203ENST00000411828 959 ntTSL 321.77■■□□□ 1.086e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.036e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.026e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-225ENST00000489897 998 ntTSL 520.95■□□□□ 0.946e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.926e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.926e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.86e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.736e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-230ENST00000530154 1670 ntTSL 219.58■□□□□ 0.726e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 PSMG1-204ENST00000431628 760 ntTSL 1 (best)18.78■□□□□ 0.66e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.426e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.376e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 317.18■□□□□ 0.346e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.276e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.226e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.186e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.126e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.046e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.016e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.066e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.126e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.156e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.196e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.26e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.286e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.296e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.346e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.356e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 MGST3-201ENST00000367883 706 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.386e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 OSBP2-212ENST00000452656 2763 ntTSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.446e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 MGST3-212ENST00000495447 720 ntTSL 312.28□□□□□ -0.446e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.496e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 RBM8A-208ENST00000634130 565 ntTSL 211.91□□□□□ -0.56e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-210ENST00000361746 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.546e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.576e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 RBM8A-205ENST00000632040 495 ntTSL 211.25□□□□□ -0.616e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-229ENST00000528371 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.626e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.626e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-231ENST00000530581 893 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.666e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.676e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.686e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-217ENST00000372369 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.76e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.716e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-216ENST00000372368 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.756e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.756e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.786e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 OSBP2-204ENST00000407373 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.786e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.86e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.86e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.826e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.826e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-236ENST00000533212 781 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.826e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.836e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD2-206ENST00000439383 2633 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.876e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.986e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.036e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 MGST3-202ENST00000367884 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.16e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 MGST3-211ENST00000494074 772 ntTSL 27.71□□□□□ -1.186e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.26e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.26e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-221ENST00000461375 806 ntTSL 57.21□□□□□ -1.266e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 RBM8A-207ENST00000633781 440 ntTSL 26.99□□□□□ -1.296e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.436e-6■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 VTI1B-201ENST00000216456 1103 ntTSL 1 (best)24.31■■□□□ 1.485e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.225e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.355e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DDX3X-212ENST00000616050 818 ntTSL 512.43□□□□□ -0.425e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.655e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DDX3X-215ENST00000625837 3237 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.735e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DDX3X-216ENST00000626301 3013 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.745e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.765e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DDX3X-220ENST00000630370 3120 ntTSL 59.58□□□□□ -0.885e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DDX3X-218ENST00000629785 3457 ntTSL 59.47□□□□□ -0.895e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DDX3X-219ENST00000630255 3289 ntTSL 59.13□□□□□ -0.955e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 VTI1B-206ENST00000556461 576 ntTSL 28.83□□□□□ -15e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DDX3X-221ENST00000630858 3181 ntTSL 58.79□□□□□ -15e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 DDX3X-204ENST00000478993 3397 ntTSL 1 (best)8.75□□□□□ -1.015e-7■■■■□ 24.2
APOBEC3CQ9NRW3 VTI1B-203ENST00000554636 565 ntTSL 34.5□□□□□ -1.695e-7■■■■□ 24.2
Retrieved 100 of 4,302 protein–RNA pairs in 20.9 ms