Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calm4Q9JM83 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calm4Q9JM83 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calm4Q9JM83 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calm4Q9JM83 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calm4Q9JM83 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calm4Q9JM83 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calm4Q9JM83 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calm4Q9JM83 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calm4Q9JM83 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calm4Q9JM83 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calm4Q9JM83 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calm4Q9JM83 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calm4Q9JM83 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Calm4Q9JM83 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm4Q9JM83 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calm4Q9JM83 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calm4Q9JM83 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm4Q9JM83 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms