Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul3Q9JLV5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul3Q9JLV5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul3Q9JLV5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul3Q9JLV5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul3Q9JLV5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul3Q9JLV5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul3Q9JLV5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul3Q9JLV5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul3Q9JLV5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul3Q9JLV5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul3Q9JLV5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cul3Q9JLV5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cul3Q9JLV5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cul3Q9JLV5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cul3Q9JLV5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul3Q9JLV5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul3Q9JLV5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms