Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3m1Q9JKC8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3m1Q9JKC8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3m1Q9JKC8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3m1Q9JKC8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap3m1Q9JKC8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3m1Q9JKC8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3m1Q9JKC8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ap3m1Q9JKC8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3m1Q9JKC8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3m1Q9JKC8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3m1Q9JKC8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3m1Q9JKC8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3m1Q9JKC8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3m1Q9JKC8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3m1Q9JKC8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3m1Q9JKC8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3m1Q9JKC8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3m1Q9JKC8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3m1Q9JKC8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ap3m1Q9JKC8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3m1Q9JKC8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3m1Q9JKC8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3m1Q9JKC8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3m1Q9JKC8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3m1Q9JKC8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3m1Q9JKC8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3m1Q9JKC8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3m1Q9JKC8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3m1Q9JKC8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3m1Q9JKC8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3m1Q9JKC8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3m1Q9JKC8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3m1Q9JKC8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3m1Q9JKC8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3m1Q9JKC8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3m1Q9JKC8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ap3m1Q9JKC8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3m1Q9JKC8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3m1Q9JKC8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3m1Q9JKC8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms