Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pard6bQ9JK83 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pard6bQ9JK83 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pard6bQ9JK83 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pard6bQ9JK83 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pard6bQ9JK83 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pard6bQ9JK83 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pard6bQ9JK83 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pard6bQ9JK83 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pard6bQ9JK83 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pard6bQ9JK83 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pard6bQ9JK83 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pard6bQ9JK83 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pard6bQ9JK83 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pard6bQ9JK83 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pard6bQ9JK83 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pard6bQ9JK83 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pard6bQ9JK83 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pard6bQ9JK83 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pard6bQ9JK83 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pard6bQ9JK83 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pard6bQ9JK83 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pard6bQ9JK83 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pard6bQ9JK83 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pard6bQ9JK83 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pard6bQ9JK83 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pard6bQ9JK83 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pard6bQ9JK83 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pard6bQ9JK83 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pard6bQ9JK83 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pard6bQ9JK83 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pard6bQ9JK83 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pard6bQ9JK83 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pard6bQ9JK83 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pard6bQ9JK83 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pard6bQ9JK83 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pard6bQ9JK83 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pard6bQ9JK83 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pard6bQ9JK83 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pard6bQ9JK83 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pard6bQ9JK83 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pard6bQ9JK83 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pard6bQ9JK83 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pard6bQ9JK83 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pard6bQ9JK83 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pard6bQ9JK83 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pard6bQ9JK83 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pard6bQ9JK83 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pard6bQ9JK83 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pard6bQ9JK83 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pard6bQ9JK83 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pard6bQ9JK83 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pard6bQ9JK83 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pard6bQ9JK83 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pard6bQ9JK83 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pard6bQ9JK83 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pard6bQ9JK83 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pard6bQ9JK83 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pard6bQ9JK83 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pard6bQ9JK83 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms