Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacng4Q9JJV4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacng4Q9JJV4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacng4Q9JJV4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacng4Q9JJV4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacng4Q9JJV4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacng4Q9JJV4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacng4Q9JJV4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacng4Q9JJV4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacng4Q9JJV4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacng4Q9JJV4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacng4Q9JJV4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacng4Q9JJV4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacng4Q9JJV4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cacng4Q9JJV4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacng4Q9JJV4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacng4Q9JJV4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacng4Q9JJV4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacng4Q9JJV4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacng4Q9JJV4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacng4Q9JJV4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacng4Q9JJV4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacng4Q9JJV4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacng4Q9JJV4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacng4Q9JJV4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacng4Q9JJV4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacng4Q9JJV4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacng4Q9JJV4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacng4Q9JJV4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacng4Q9JJV4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacng4Q9JJV4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacng4Q9JJV4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacng4Q9JJV4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacng4Q9JJV4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacng4Q9JJV4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacng4Q9JJV4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cacng4Q9JJV4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacng4Q9JJV4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacng4Q9JJV4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacng4Q9JJV4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacng4Q9JJV4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacng4Q9JJV4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacng4Q9JJV4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacng4Q9JJV4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacng4Q9JJV4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacng4Q9JJV4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms