Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gfra4Q9JJT2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gfra4Q9JJT2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gfra4Q9JJT2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gfra4Q9JJT2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gfra4Q9JJT2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gfra4Q9JJT2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gfra4Q9JJT2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gfra4Q9JJT2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gfra4Q9JJT2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gfra4Q9JJT2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gfra4Q9JJT2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gfra4Q9JJT2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gfra4Q9JJT2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gfra4Q9JJT2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gfra4Q9JJT2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gfra4Q9JJT2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gfra4Q9JJT2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gfra4Q9JJT2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gfra4Q9JJT2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gfra4Q9JJT2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gfra4Q9JJT2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gfra4Q9JJT2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gfra4Q9JJT2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gfra4Q9JJT2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gfra4Q9JJT2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gfra4Q9JJT2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gfra4Q9JJT2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gfra4Q9JJT2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gfra4Q9JJT2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gfra4Q9JJT2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gfra4Q9JJT2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gfra4Q9JJT2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gfra4Q9JJT2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gfra4Q9JJT2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gfra4Q9JJT2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gfra4Q9JJT2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gfra4Q9JJT2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gfra4Q9JJT2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gfra4Q9JJT2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gfra4Q9JJT2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gfra4Q9JJT2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gfra4Q9JJT2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gfra4Q9JJT2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gfra4Q9JJT2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gfra4Q9JJT2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gfra4Q9JJT2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gfra4Q9JJT2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gfra4Q9JJT2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gfra4Q9JJT2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gfra4Q9JJT2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gfra4Q9JJT2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gfra4Q9JJT2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gfra4Q9JJT2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gfra4Q9JJT2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms