Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn12Q9ET43 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn12Q9ET43 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn12Q9ET43 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn12Q9ET43 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn12Q9ET43 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn12Q9ET43 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn12Q9ET43 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn12Q9ET43 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn12Q9ET43 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn12Q9ET43 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn12Q9ET43 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn12Q9ET43 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn12Q9ET43 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn12Q9ET43 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn12Q9ET43 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn12Q9ET43 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn12Q9ET43 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn12Q9ET43 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn12Q9ET43 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn12Q9ET43 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn12Q9ET43 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn12Q9ET43 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn12Q9ET43 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn12Q9ET43 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn12Q9ET43 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn12Q9ET43 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn12Q9ET43 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn12Q9ET43 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn12Q9ET43 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn12Q9ET43 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn12Q9ET43 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn12Q9ET43 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn12Q9ET43 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn12Q9ET43 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn12Q9ET43 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms