Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Capn10Q9ESK3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Capn10Q9ESK3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Capn10Q9ESK3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Capn10Q9ESK3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Capn10Q9ESK3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Capn10Q9ESK3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Capn10Q9ESK3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Capn10Q9ESK3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Capn10Q9ESK3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Capn10Q9ESK3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Capn10Q9ESK3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Capn10Q9ESK3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Capn10Q9ESK3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Capn10Q9ESK3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Capn10Q9ESK3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Capn10Q9ESK3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Capn10Q9ESK3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Capn10Q9ESK3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Capn10Q9ESK3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Capn10Q9ESK3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn10Q9ESK3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Capn10Q9ESK3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Capn10Q9ESK3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Capn10Q9ESK3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Capn10Q9ESK3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Capn10Q9ESK3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Capn10Q9ESK3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Capn10Q9ESK3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Capn10Q9ESK3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Capn10Q9ESK3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Capn10Q9ESK3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Capn10Q9ESK3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Capn10Q9ESK3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Capn10Q9ESK3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Capn10Q9ESK3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Capn10Q9ESK3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Capn10Q9ESK3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Capn10Q9ESK3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Capn10Q9ESK3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Capn10Q9ESK3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Capn10Q9ESK3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Capn10Q9ESK3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Capn10Q9ESK3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Capn10Q9ESK3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Capn10Q9ESK3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Capn10Q9ESK3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Capn10Q9ESK3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Capn10Q9ESK3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Capn10Q9ESK3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Capn10Q9ESK3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Capn10Q9ESK3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Capn10Q9ESK3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Capn10Q9ESK3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Capn10Q9ESK3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Capn10Q9ESK3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Capn10Q9ESK3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Capn10Q9ESK3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Capn10Q9ESK3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Capn10Q9ESK3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Capn10Q9ESK3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Capn10Q9ESK3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Capn10Q9ESK3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Capn10Q9ESK3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Capn10Q9ESK3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Capn10Q9ESK3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Capn10Q9ESK3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Capn10Q9ESK3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Capn10Q9ESK3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Capn10Q9ESK3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Capn10Q9ESK3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Capn10Q9ESK3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Capn10Q9ESK3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Capn10Q9ESK3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Capn10Q9ESK3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Capn10Q9ESK3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Capn10Q9ESK3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Capn10Q9ESK3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Capn10Q9ESK3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Capn10Q9ESK3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Capn10Q9ESK3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capn10Q9ESK3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capn10Q9ESK3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Capn10Q9ESK3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Capn10Q9ESK3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Capn10Q9ESK3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Capn10Q9ESK3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Capn10Q9ESK3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Capn10Q9ESK3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn10Q9ESK3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn10Q9ESK3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn10Q9ESK3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Capn10Q9ESK3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Capn10Q9ESK3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Capn10Q9ESK3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Capn10Q9ESK3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Capn10Q9ESK3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Capn10Q9ESK3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Capn10Q9ESK3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Capn10Q9ESK3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms