Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp3a44Q9EQW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp3a44Q9EQW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp3a44Q9EQW4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a44Q9EQW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp3a44Q9EQW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp3a44Q9EQW4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a44Q9EQW4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp3a44Q9EQW4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp3a44Q9EQW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms