Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem43Q9DBS1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem43Q9DBS1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem43Q9DBS1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem43Q9DBS1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem43Q9DBS1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem43Q9DBS1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem43Q9DBS1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem43Q9DBS1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem43Q9DBS1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem43Q9DBS1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem43Q9DBS1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem43Q9DBS1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem43Q9DBS1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem43Q9DBS1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem43Q9DBS1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem43Q9DBS1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem43Q9DBS1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem43Q9DBS1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem43Q9DBS1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem43Q9DBS1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem43Q9DBS1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem43Q9DBS1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem43Q9DBS1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem43Q9DBS1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem43Q9DBS1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem43Q9DBS1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem43Q9DBS1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms