Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efhc1Q9D9T8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhc1Q9D9T8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhc1Q9D9T8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhc1Q9D9T8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhc1Q9D9T8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efhc1Q9D9T8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efhc1Q9D9T8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efhc1Q9D9T8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhc1Q9D9T8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhc1Q9D9T8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhc1Q9D9T8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhc1Q9D9T8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhc1Q9D9T8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efhc1Q9D9T8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efhc1Q9D9T8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efhc1Q9D9T8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efhc1Q9D9T8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efhc1Q9D9T8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efhc1Q9D9T8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efhc1Q9D9T8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efhc1Q9D9T8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efhc1Q9D9T8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efhc1Q9D9T8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efhc1Q9D9T8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efhc1Q9D9T8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efhc1Q9D9T8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efhc1Q9D9T8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efhc1Q9D9T8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhc1Q9D9T8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efhc1Q9D9T8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms