Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Actrt1Q9D9J3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actrt1Q9D9J3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actrt1Q9D9J3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actrt1Q9D9J3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actrt1Q9D9J3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actrt1Q9D9J3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actrt1Q9D9J3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actrt1Q9D9J3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Actrt1Q9D9J3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actrt1Q9D9J3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actrt1Q9D9J3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actrt1Q9D9J3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actrt1Q9D9J3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actrt1Q9D9J3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actrt1Q9D9J3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actrt1Q9D9J3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actrt1Q9D9J3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actrt1Q9D9J3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actrt1Q9D9J3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actrt1Q9D9J3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Actrt1Q9D9J3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actrt1Q9D9J3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actrt1Q9D9J3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actrt1Q9D9J3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms