Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd12Q9D8W5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd12Q9D8W5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd12Q9D8W5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd12Q9D8W5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd12Q9D8W5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd12Q9D8W5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd12Q9D8W5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd12Q9D8W5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmd12Q9D8W5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd12Q9D8W5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd12Q9D8W5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd12Q9D8W5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd12Q9D8W5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd12Q9D8W5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd12Q9D8W5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd12Q9D8W5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd12Q9D8W5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd12Q9D8W5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd12Q9D8W5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd12Q9D8W5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd12Q9D8W5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd12Q9D8W5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmd12Q9D8W5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmd12Q9D8W5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmd12Q9D8W5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmd12Q9D8W5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd12Q9D8W5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd12Q9D8W5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd12Q9D8W5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd12Q9D8W5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd12Q9D8W5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd12Q9D8W5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd12Q9D8W5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms