Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7G0

Prps1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps1Q9D7G0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prps1Q9D7G0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prps1Q9D7G0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prps1Q9D7G0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prps1Q9D7G0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prps1Q9D7G0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prps1Q9D7G0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prps1Q9D7G0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prps1Q9D7G0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prps1Q9D7G0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prps1Q9D7G0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prps1Q9D7G0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prps1Q9D7G0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prps1Q9D7G0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prps1Q9D7G0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prps1Q9D7G0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prps1Q9D7G0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prps1Q9D7G0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prps1Q9D7G0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prps1Q9D7G0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prps1Q9D7G0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prps1Q9D7G0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prps1Q9D7G0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms