Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lonrf3Q9D4H7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lonrf3Q9D4H7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lonrf3Q9D4H7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Lonrf3Q9D4H7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lonrf3Q9D4H7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lonrf3Q9D4H7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Lonrf3Q9D4H7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lonrf3Q9D4H7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lonrf3Q9D4H7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lonrf3Q9D4H7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lonrf3Q9D4H7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lonrf3Q9D4H7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lonrf3Q9D4H7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lonrf3Q9D4H7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lonrf3Q9D4H7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lonrf3Q9D4H7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lonrf3Q9D4H7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lonrf3Q9D4H7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Lonrf3Q9D4H7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lonrf3Q9D4H7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lonrf3Q9D4H7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lonrf3Q9D4H7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lonrf3Q9D4H7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lonrf3Q9D4H7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lonrf3Q9D4H7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lonrf3Q9D4H7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Lonrf3Q9D4H7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lonrf3Q9D4H7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lonrf3Q9D4H7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lonrf3Q9D4H7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lonrf3Q9D4H7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lonrf3Q9D4H7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lonrf3Q9D4H7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lonrf3Q9D4H7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lonrf3Q9D4H7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lonrf3Q9D4H7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lonrf3Q9D4H7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lonrf3Q9D4H7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lonrf3Q9D4H7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lonrf3Q9D4H7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lonrf3Q9D4H7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lonrf3Q9D4H7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lonrf3Q9D4H7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lonrf3Q9D4H7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lonrf3Q9D4H7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lonrf3Q9D4H7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Lonrf3Q9D4H7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lonrf3Q9D4H7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lonrf3Q9D4H7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lonrf3Q9D4H7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lonrf3Q9D4H7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lonrf3Q9D4H7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lonrf3Q9D4H7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Lonrf3Q9D4H7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lonrf3Q9D4H7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lonrf3Q9D4H7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lonrf3Q9D4H7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lonrf3Q9D4H7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lonrf3Q9D4H7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lonrf3Q9D4H7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lonrf3Q9D4H7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lonrf3Q9D4H7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lonrf3Q9D4H7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lonrf3Q9D4H7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lonrf3Q9D4H7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lonrf3Q9D4H7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lonrf3Q9D4H7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lonrf3Q9D4H7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lonrf3Q9D4H7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lonrf3Q9D4H7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Lonrf3Q9D4H7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lonrf3Q9D4H7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lonrf3Q9D4H7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lonrf3Q9D4H7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lonrf3Q9D4H7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lonrf3Q9D4H7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lonrf3Q9D4H7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Lonrf3Q9D4H7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms