Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl8bQ9D1F0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl8bQ9D1F0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rtl8bQ9D1F0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rtl8bQ9D1F0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtl8bQ9D1F0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtl8bQ9D1F0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtl8bQ9D1F0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms