Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D131 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D131 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D131 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D131 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D131 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D131 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D131 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D131 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D131 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D131 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D131 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D131 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D131 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D131 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D131 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D131 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D131 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D131 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D131 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D131 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D131 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D131 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D131 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D131 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D131 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q9D131 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D131 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D131 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D131 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D131 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D131 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D131 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D131 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D131 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D131 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D131 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D131 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D131 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D131 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D131 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D131 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D131 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D131 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D131 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D131 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D131 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D131 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D131 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D131 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D131 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D131 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D131 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D131 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D131 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D131 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D131 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D131 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D131 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D131 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D131 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D131 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D131 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D131 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D131 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D131 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D131 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D131 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D131 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D131 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D131 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D131 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D131 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D131 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D131 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D131 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D131 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D131 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D131 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D131 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D131 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D131 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D131 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D131 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D131 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D131 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D131 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D131 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D131 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D131 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D131 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D131 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D131 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D131 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D131 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D131 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D131 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D131 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D131 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D131 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms