Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmem39aQ9CYC3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem39aQ9CYC3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmem39aQ9CYC3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmem39aQ9CYC3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmem39aQ9CYC3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmem39aQ9CYC3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmem39aQ9CYC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem39aQ9CYC3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem39aQ9CYC3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmem39aQ9CYC3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tmem39aQ9CYC3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem39aQ9CYC3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem39aQ9CYC3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem39aQ9CYC3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem39aQ9CYC3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem39aQ9CYC3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmem39aQ9CYC3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmem39aQ9CYC3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmem39aQ9CYC3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmem39aQ9CYC3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem39aQ9CYC3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmem39aQ9CYC3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmem39aQ9CYC3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmem39aQ9CYC3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmem39aQ9CYC3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmem39aQ9CYC3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmem39aQ9CYC3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmem39aQ9CYC3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmem39aQ9CYC3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmem39aQ9CYC3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmem39aQ9CYC3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmem39aQ9CYC3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmem39aQ9CYC3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tmem39aQ9CYC3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmem39aQ9CYC3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmem39aQ9CYC3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmem39aQ9CYC3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tmem39aQ9CYC3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmem39aQ9CYC3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmem39aQ9CYC3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Tmem39aQ9CYC3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmem39aQ9CYC3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmem39aQ9CYC3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tmem39aQ9CYC3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmem39aQ9CYC3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmem39aQ9CYC3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmem39aQ9CYC3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmem39aQ9CYC3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmem39aQ9CYC3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmem39aQ9CYC3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmem39aQ9CYC3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmem39aQ9CYC3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmem39aQ9CYC3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms