Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sgo1Q9CXH7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo1Q9CXH7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgo1Q9CXH7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sgo1Q9CXH7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgo1Q9CXH7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgo1Q9CXH7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgo1Q9CXH7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgo1Q9CXH7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sgo1Q9CXH7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sgo1Q9CXH7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sgo1Q9CXH7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgo1Q9CXH7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgo1Q9CXH7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgo1Q9CXH7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sgo1Q9CXH7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sgo1Q9CXH7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgo1Q9CXH7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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