Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnih4Q9CX13 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnih4Q9CX13 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnih4Q9CX13 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnih4Q9CX13 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnih4Q9CX13 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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