Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smurf1Q9CUN6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smurf1Q9CUN6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smurf1Q9CUN6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smurf1Q9CUN6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smurf1Q9CUN6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smurf1Q9CUN6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smurf1Q9CUN6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smurf1Q9CUN6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smurf1Q9CUN6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smurf1Q9CUN6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smurf1Q9CUN6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smurf1Q9CUN6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smurf1Q9CUN6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smurf1Q9CUN6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smurf1Q9CUN6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smurf1Q9CUN6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smurf1Q9CUN6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smurf1Q9CUN6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smurf1Q9CUN6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smurf1Q9CUN6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smurf1Q9CUN6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smurf1Q9CUN6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smurf1Q9CUN6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smurf1Q9CUN6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smurf1Q9CUN6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smurf1Q9CUN6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smurf1Q9CUN6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smurf1Q9CUN6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smurf1Q9CUN6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smurf1Q9CUN6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smurf1Q9CUN6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smurf1Q9CUN6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smurf1Q9CUN6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smurf1Q9CUN6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smurf1Q9CUN6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smurf1Q9CUN6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smurf1Q9CUN6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smurf1Q9CUN6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smurf1Q9CUN6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smurf1Q9CUN6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smurf1Q9CUN6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms