Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc5Q9CRA8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Exosc5Q9CRA8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Exosc5Q9CRA8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Exosc5Q9CRA8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Exosc5Q9CRA8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Exosc5Q9CRA8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms