Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm4sf20Q9CQY8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tm4sf20Q9CQY8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm4sf20Q9CQY8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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