Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc2Q9CQP2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc2Q9CQP2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc2Q9CQP2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc2Q9CQP2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc2Q9CQP2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc2Q9CQP2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc2Q9CQP2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc2Q9CQP2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc2Q9CQP2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc2Q9CQP2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc2Q9CQP2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc2Q9CQP2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc2Q9CQP2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc2Q9CQP2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc2Q9CQP2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc2Q9CQP2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trappc2Q9CQP2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc2Q9CQP2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc2Q9CQP2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc2Q9CQP2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc2Q9CQP2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc2Q9CQP2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc2Q9CQP2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc2Q9CQP2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc2Q9CQP2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc2Q9CQP2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc2Q9CQP2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc2Q9CQP2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc2Q9CQP2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc2Q9CQP2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc2Q9CQP2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc2Q9CQP2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms