Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DenrQ9CQJ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DenrQ9CQJ6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DenrQ9CQJ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DenrQ9CQJ6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DenrQ9CQJ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DenrQ9CQJ6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DenrQ9CQJ6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DenrQ9CQJ6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DenrQ9CQJ6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DenrQ9CQJ6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DenrQ9CQJ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DenrQ9CQJ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DenrQ9CQJ6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DenrQ9CQJ6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DenrQ9CQJ6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DenrQ9CQJ6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DenrQ9CQJ6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DenrQ9CQJ6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DenrQ9CQJ6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DenrQ9CQJ6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms