Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ5

Prr13, Proline-rich protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr13Q9CQJ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prr13Q9CQJ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prr13Q9CQJ5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr13Q9CQJ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms