Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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