Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQF4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQF4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQF4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQF4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQF4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQF4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CQF4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CQF4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CQF4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CQF4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CQF4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CQF4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CQF4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CQF4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9CQF4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9CQF4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CQF4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9CQF4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CQF4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CQF4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CQF4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CQF4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CQF4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms