Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox6cQ9CPQ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox6cQ9CPQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox6cQ9CPQ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms