Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntnap4Q99P47 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntnap4Q99P47 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntnap4Q99P47 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntnap4Q99P47 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntnap4Q99P47 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cntnap4Q99P47 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cntnap4Q99P47 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cntnap4Q99P47 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cntnap4Q99P47 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cntnap4Q99P47 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cntnap4Q99P47 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cntnap4Q99P47 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cntnap4Q99P47 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cntnap4Q99P47 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cntnap4Q99P47 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.6 ms