Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vgll1Q99NC0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll1Q99NC0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vgll1Q99NC0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vgll1Q99NC0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vgll1Q99NC0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vgll1Q99NC0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll1Q99NC0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll1Q99NC0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll1Q99NC0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll1Q99NC0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll1Q99NC0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll1Q99NC0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll1Q99NC0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms