Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkd1Q99MH6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkd1Q99MH6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkd1Q99MH6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkd1Q99MH6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkd1Q99MH6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkd1Q99MH6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkd1Q99MH6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkd1Q99MH6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkd1Q99MH6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkd1Q99MH6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkd1Q99MH6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkd1Q99MH6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkd1Q99MH6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkd1Q99MH6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkd1Q99MH6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkd1Q99MH6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkd1Q99MH6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkd1Q99MH6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkd1Q99MH6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkd1Q99MH6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkd1Q99MH6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkd1Q99MH6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkd1Q99MH6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkd1Q99MH6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkd1Q99MH6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkd1Q99MH6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkd1Q99MH6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkd1Q99MH6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkd1Q99MH6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkd1Q99MH6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkd1Q99MH6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkd1Q99MH6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkd1Q99MH6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkd1Q99MH6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkd1Q99MH6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkd1Q99MH6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkd1Q99MH6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkd1Q99MH6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkd1Q99MH6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkd1Q99MH6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms