Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp1b1Q99LU0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp1b1Q99LU0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp1b1Q99LU0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp1b1Q99LU0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp1b1Q99LU0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp1b1Q99LU0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp1b1Q99LU0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp1b1Q99LU0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp1b1Q99LU0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp1b1Q99LU0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp1b1Q99LU0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp1b1Q99LU0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp1b1Q99LU0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp1b1Q99LU0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp1b1Q99LU0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp1b1Q99LU0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp1b1Q99LU0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp1b1Q99LU0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp1b1Q99LU0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp1b1Q99LU0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp1b1Q99LU0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp1b1Q99LU0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp1b1Q99LU0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp1b1Q99LU0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp1b1Q99LU0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp1b1Q99LU0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms